169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0569 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 781 aa  1599    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  48.49 
 
 		 772 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  36.61 
 
 		 1363 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  44.29 
 
 		 468 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  46.61 
 
 		 791 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  51.52 
 
 		 436 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  45 
 
 		 558 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  50.51 
 
 		 561 aa  90.9  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  46.46 
 
 		 621 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  47.57 
 
 		 772 aa  88.6  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.05 
 
 		 700 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.21 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  31.65 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.51 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  42.05 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  44.05 
 
 		 743 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 854 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  42.17 
 
 		 913 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.53 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  46.84 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  34.62 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.89 
 
 		 984 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  46.25 
 
 		 842 aa  65.1  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.57 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  43.9 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  41.3 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  45.12 
 
 		 938 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  27.54 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  41.07 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 1209 aa  63.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  40.7 
 
 		 846 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  38.14 
 
 		 1007 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  37.93 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  39.6 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.41 
 
 		 867 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  37.21 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  42.31 
 
 		 442 aa  62  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.76 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  41.57 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.15 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  36.97 
 
 		 842 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 812 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  33.96 
 
 		 746 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  37.65 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.7 
 
 		 609 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  37.21 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  32.59 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.86 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  37.21 
 
 		 763 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.45 
 
 		 486 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  36.75 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  39.29 
 
 		 688 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  41.89 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.21 
 
 		 1298 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  38.37 
 
 		 403 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 1137 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  35.29 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  38.55 
 
 		 674 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.14 
 
 		 580 aa  60.1  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  30.83 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35.96 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.44 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  37.93 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.53 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  37.8 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  37.8 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  41.77 
 
 		 880 aa  58.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  37.8 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  37.8 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  37.8 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.21 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  37.61 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.21 
 
 		 778 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  38.54 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  40.24 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  36.47 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  31.43 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 1128 aa  57.4  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  33.59 
 
 		 669 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.47 
 
 		 491 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  30.84 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  37.5 
 
 		 674 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 		 633 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.37 
 
 		 453 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.45 
 
 		 998 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  41.67 
 
 		 656 aa  55.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 678 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  37.5 
 
 		 674 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  38.1 
 
 		 673 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  39.53 
 
 		 485 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.29 
 
 		 479 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  31.68 
 
 		 774 aa  55.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  36.17 
 
 		 914 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  33 
 
 		 429 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  35.04 
 
 		 744 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  34.52 
 
 		 474 aa  54.7  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  39.74 
 
 		 775 aa  55.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  29.66 
 
 		 613 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>