231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3420 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 725 aa  1467    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  60.09 
 
 		 619 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  28.12 
 
 		 614 aa  137  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  26.93 
 
 		 496 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  27.97 
 
 		 480 aa  132  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  48.79 
 
 		 558 aa  128  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  63.54 
 
 		 867 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 		 621 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  27.48 
 
 		 566 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  52.17 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  57.29 
 
 		 791 aa  104  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 633 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  25.12 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  23.62 
 
 		 2305 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  24.29 
 
 		 1414 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  25.47 
 
 		 597 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 526 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  26.38 
 
 		 649 aa  97.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 608 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  23.46 
 
 		 2310 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  46.85 
 
 		 933 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  41.67 
 
 		 787 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  23.89 
 
 		 534 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  45.69 
 
 		 700 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 658 aa  94  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 562 aa  93.2  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  24.76 
 
 		 619 aa  92  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  51.69 
 
 		 477 aa  87.4  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  24.89 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  22.97 
 
 		 580 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  29.46 
 
 		 767 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.12 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  47.06 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.05 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  47.06 
 
 		 854 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.52 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  47.78 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  46.32 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  43.75 
 
 		 746 aa  79  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.25 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  47.42 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  42.73 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  41.82 
 
 		 744 aa  77.4  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  48.81 
 
 		 460 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  36.44 
 
 		 854 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 846 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.71 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  48.35 
 
 		 393 aa  76.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.76 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.51 
 
 		 979 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  42.27 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  75.56 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  43.53 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42.22 
 
 		 966 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  28.26 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  44.44 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.86 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40.22 
 
 		 623 aa  74.3  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  45.65 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.12 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.3 
 
 		 842 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 1128 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45.36 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.42 
 
 		 984 aa  73.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  44.09 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  39.53 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  43.68 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.12 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  45.26 
 
 		 1209 aa  72  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.18 
 
 		 913 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  48.81 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41.11 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.43 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.94 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  45.26 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 963 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  40 
 
 		 894 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.86 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  39.56 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1882  hypothetical protein  24.72 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  42.5 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  39.13 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  31.62 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1893  hypothetical protein  24.72 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  38.68 
 
 		 934 aa  67.8  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.86 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  36.63 
 
 		 785 aa  68.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.68 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  35.16 
 
 		 990 aa  67  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.63 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.36 
 
 		 487 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  38.46 
 
 		 681 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  40.24 
 
 		 376 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  38.82 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  35.79 
 
 		 906 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  36.17 
 
 		 880 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>