14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1893 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1893  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  984    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1882  hypothetical protein  98.74 
 
 		 476 aa  971    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  25.74 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  24.32 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  26.14 
 
 		 649 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 563 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  21.79 
 
 		 614 aa  50.1  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 526 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  22 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  22.92 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  23.79 
 
 		 496 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  23.79 
 
 		 597 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>