212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2939 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2939  ATPase  100 
 
 		 787 aa  1605    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0547  beta-propeller domain-containing protein  29.7 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1761  hypothetical protein  25.43 
 
 		 680 aa  155  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  23.66 
 
 		 845 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1971  hypothetical protein  25.24 
 
 		 644 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3465  secreted protein  25.6 
 
 		 690 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6043  Secreted protein  27.91 
 
 		 635 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.557993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3067  putative lipoprotein  26.84 
 
 		 698 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257296  normal  0.354742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0009  secreted protein  23.16 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00303672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4531  hypothetical protein  54.95 
 
 		 632 aa  104  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.420063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  47.86 
 
 		 511 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2091  hypothetical protein  25.5 
 
 		 693 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1144  hypothetical protein  28.01 
 
 		 662 aa  100  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  40 
 
 		 700 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3362  C-terminal beta- propeller domain-contain secreted protein-like protein  36.17 
 
 		 697 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1174  Secreted protein containing C-terminal beta- propeller domain distantly related to WD-40 repeats-like protein  36.17 
 
 		 711 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0471  copper amine oxidase-like protein  32.62 
 
 		 741 aa  99.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0141512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1856  hypothetical protein  23.21 
 
 		 690 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2884  Beta propeller domain protein  33.47 
 
 		 685 aa  97.8  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0251  hypothetical protein  35.5 
 
 		 745 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0926046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5041  hypothetical protein  41.35 
 
 		 625 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0353  hypothetical protein  29.41 
 
 		 635 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116012  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0966  hypothetical protein  36.09 
 
 		 745 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1662  hypothetical protein  30.73 
 
 		 746 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0931092  normal  0.879448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2006  hypothetical protein  24.75 
 
 		 691 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1498  hypothetical protein  42.22 
 
 		 682 aa  94  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  41.67 
 
 		 725 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  39.13 
 
 		 933 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1559  hypothetical protein  34.57 
 
 		 741 aa  90.9  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2127  hypothetical protein  25.25 
 
 		 652 aa  84  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.24 
 
 		 867 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.71 
 
 		 934 aa  80.9  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2462  hypothetical protein  40.31 
 
 		 652 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1330  hypothetical protein  37.04 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.696713 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43674  predicted protein  31.45 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  41.41 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 963 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  32.8 
 
 		 669 aa  72  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  36.56 
 
 		 791 aa  71.2  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1394  hypothetical protein  32.93 
 
 		 677 aa  70.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46646  normal  0.639448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  41.76 
 
 		 637 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  39.53 
 
 		 436 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 966 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  42.35 
 
 		 894 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.35 
 
 		 746 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  35.92 
 
 		 773 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.14 
 
 		 979 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  38.82 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  34.95 
 
 		 376 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  37.38 
 
 		 744 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  36.84 
 
 		 842 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  36.46 
 
 		 775 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  40.86 
 
 		 1209 aa  66.6  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.86 
 
 		 763 aa  66.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.64 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  43.9 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  37.93 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  35.63 
 
 		 925 aa  64.7  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  35.65 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  34.04 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  39.53 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35 
 
 		 984 aa  64.3  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  32.63 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  36.47 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.94 
 
 		 778 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  36.78 
 
 		 494 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  35.29 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  38.46 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  39.53 
 
 		 854 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  34.74 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  38.46 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  37.8 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.63 
 
 		 998 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  34.04 
 
 		 727 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.33 
 
 		 437 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 854 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  34.88 
 
 		 942 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  34.04 
 
 		 875 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  32.74 
 
 		 488 aa  62  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  35.42 
 
 		 990 aa  62  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  35.71 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  42.11 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.82 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  35.8 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.82 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  38.27 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  35.51 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 1055 aa  60.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  32.38 
 
 		 596 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.74 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  31.96 
 
 		 880 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 894 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 		 1137 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  37.04 
 
 		 460 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.74 
 
 		 474 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.26 
 
 		 743 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>