145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0650 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  100 
 
 		 558 aa  1054    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  61.61 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  48.62 
 
 		 725 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  47.9 
 
 		 772 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  47.09 
 
 		 621 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  47.33 
 
 		 791 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  54.08 
 
 		 436 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  50 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  45 
 
 		 781 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  71.74 
 
 		 867 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  40.43 
 
 		 913 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.77 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  28.16 
 
 		 842 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.85 
 
 		 746 aa  70.5  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.12 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  43.75 
 
 		 842 aa  68.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  40.2 
 
 		 2305 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  40.24 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.03 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 		 1209 aa  67  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 1055 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  32.58 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.89 
 
 		 2310 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  40.23 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  39.22 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  35.65 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.25 
 
 		 773 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  38.46 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  38.75 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.83 
 
 		 984 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  40.66 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  40.45 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  36.71 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  40.91 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  40.24 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 854 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 		 1128 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  36.96 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  32.04 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  35.4 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1699  hypothetical protein  26.87 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.04 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  37.36 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  32.71 
 
 		 925 aa  58.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  40.79 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  32.43 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.75 
 
 		 778 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  42.86 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  37.8 
 
 		 1298 aa  58.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  35.44 
 
 		 934 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  34.29 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  36.75 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 846 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.29 
 
 		 366 aa  57  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  30.91 
 
 		 511 aa  57  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  31.54 
 
 		 613 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 633 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  30.17 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  37.97 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  32.73 
 
 		 700 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  34.29 
 
 		 488 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.98 
 
 		 743 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 488 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 1121 aa  54.7  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  37 
 
 		 608 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  27.73 
 
 		 851 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  36.78 
 
 		 938 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  36.36 
 
 		 756 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  32.52 
 
 		 605 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  38.67 
 
 		 727 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.86 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  57.14 
 
 		 767 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  35.56 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  31.31 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  26.32 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  32.04 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  33.73 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.38 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.42 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  35.71 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  33.01 
 
 		 1007 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  35.63 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  33.33 
 
 		 787 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  30.49 
 
 		 847 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  29.89 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  36.36 
 
 		 453 aa  51.2  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 		 562 aa  51.2  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 935 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  33.33 
 
 		 880 aa  50.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  29.41 
 
 		 774 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  27.88 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  28.1 
 
 		 539 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  36.46 
 
 		 894 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  35 
 
 		 794 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  32.1 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  29.82 
 
 		 652 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  30.68 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>