13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3852 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 989 aa  1979    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1612  hypothetical protein  26.52 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0939713  normal  0.0780144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  26.53 
 
 		 1393 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.19 
 
 		 1779 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  26.02 
 
 		 1393 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  26.24 
 
 		 3244 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  26.69 
 
 		 635 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0178  hypothetical protein  25.54 
 
 		 786 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  26.57 
 
 		 2079 aa  51.6  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  25 
 
 		 506 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  26.69 
 
 		 635 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6710  NHL repeat containing protein  38.71 
 
 		 692 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  21.64 
 
 		 1418 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>