94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0152 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0152  PKD  100 
 
 		 506 aa  1011    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  31.57 
 
 		 1011 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  29.71 
 
 		 1376 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  31.02 
 
 		 635 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  30.29 
 
 		 634 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  30.94 
 
 		 635 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  27.22 
 
 		 1771 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  35.91 
 
 		 1022 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  25.21 
 
 		 1057 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.39 
 
 		 3278 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  32.97 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  29.1 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  25.4 
 
 		 734 aa  66.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.17 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.53 
 
 		 816 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  30.37 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  25.93 
 
 		 4120 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  26.23 
 
 		 1565 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  36.7 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  39.36 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.11 
 
 		 1212 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  27.89 
 
 		 1779 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  28.67 
 
 		 1725 aa  57.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.29 
 
 		 994 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  26.96 
 
 		 1107 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  30.72 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  26.32 
 
 		 623 aa  55.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  26.46 
 
 		 2853 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 		 650 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.73 
 
 		 1217 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  35.54 
 
 		 972 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.12 
 
 		 1092 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  33.1 
 
 		 985 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.27 
 
 		 861 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  35.42 
 
 		 634 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.44 
 
 		 1631 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.05 
 
 		 773 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  23.44 
 
 		 3927 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 		 11716 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1504  alpha amylase catalytic region  41.54 
 
 		 728 aa  50.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.496352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  24.25 
 
 		 3197 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  24.55 
 
 		 841 aa  50.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  23.15 
 
 		 2656 aa  50.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  39.39 
 
 		 1142 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  24.6 
 
 		 1739 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  27.5 
 
 		 2079 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  35.8 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  27.35 
 
 		 3244 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  24.7 
 
 		 820 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 1151 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  38.81 
 
 		 660 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  25 
 
 		 989 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  25.4 
 
 		 2820 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.94 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.04 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  27.85 
 
 		 1029 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  31.11 
 
 		 2169 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  33.04 
 
 		 1367 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.95 
 
 		 868 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.36 
 
 		 2272 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  27.29 
 
 		 2153 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.83 
 
 		 855 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  34.17 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.11 
 
 		 868 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  31.33 
 
 		 656 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3893  hypothetical protein  27.27 
 
 		 640 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  29.58 
 
 		 1393 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.73 
 
 		 868 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  28.57 
 
 		 1204 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 1127 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.61 
 
 		 848 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1667 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1208 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  24.24 
 
 		 1150 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  29.6 
 
 		 1104 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.1 
 
 		 999 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  28.7 
 
 		 918 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  33.71 
 
 		 984 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 2476 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  29.6 
 
 		 1104 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  24.89 
 
 		 2454 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.85 
 
 		 1138 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.43 
 
 		 5787 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  29.23 
 
 		 587 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.53 
 
 		 1911 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  28.63 
 
 		 1127 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02195  chitinase  32.98 
 
 		 182 aa  43.9  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  28.74 
 
 		 918 aa  43.9  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  33.91 
 
 		 1441 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1124 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.15 
 
 		 869 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1013  PKD domain-containing protein  25.1 
 
 		 842 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000167268  normal  0.298358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>