37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0815 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  100 
 
 
1124 aa  2281    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  39.1 
 
 
2656 aa  445  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.43 
 
 
1152 aa  91.3  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  30.8 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  25.41 
 
 
1779 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  29.79 
 
 
293 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  27.97 
 
 
301 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  29.88 
 
 
295 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  26.46 
 
 
774 aa  62.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  21.96 
 
 
744 aa  59.7  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  25.06 
 
 
1601 aa  60.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2547  triple tyrosine motif-containing protein  22.22 
 
 
686 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2250  triple tyrosine motif-containing protein  22.75 
 
 
681 aa  56.2  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  23.87 
 
 
2820 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2477  PKD domain containing protein  23.92 
 
 
393 aa  52.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.44 
 
 
1092 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  23.87 
 
 
1127 aa  52.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  24.32 
 
 
327 aa  52  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  24.04 
 
 
1219 aa  51.6  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  26.14 
 
 
993 aa  51.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.16 
 
 
1127 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  30.6 
 
 
322 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 
1127 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  26.86 
 
 
329 aa  49.3  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  26.7 
 
 
325 aa  49.3  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  29.02 
 
 
322 aa  48.9  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  30.12 
 
 
215 aa  48.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  22.76 
 
 
675 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  28.12 
 
 
365 aa  47.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  25.15 
 
 
482 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.48 
 
 
3197 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  27.75 
 
 
323 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  27.37 
 
 
1096 aa  45.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  26.04 
 
 
329 aa  45.4  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 
1129 aa  45.4  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  25.62 
 
 
1123 aa  44.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  23.69 
 
 
846 aa  44.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>