38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1133 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  585  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  53.66 
 
 
301 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  51.02 
 
 
293 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  44.41 
 
 
291 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  38.82 
 
 
322 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  37.7 
 
 
322 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  38.46 
 
 
325 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  33.62 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  32.62 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  38.71 
 
 
329 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  29.02 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  35.92 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  35.5 
 
 
329 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  38.12 
 
 
329 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  30.8 
 
 
774 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  26.42 
 
 
410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  48.33 
 
 
171 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  29.45 
 
 
327 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  26.23 
 
 
328 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  26.69 
 
 
337 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  24.91 
 
 
330 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  26.56 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  34.52 
 
 
170 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  30.56 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  23.84 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  28.35 
 
 
273 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  33.93 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  48.53 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  33.94 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  34.4 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  42.42 
 
 
149 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  35.16 
 
 
215 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  34.88 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  28.99 
 
 
1124 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  34.21 
 
 
181 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  32.67 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  43.1 
 
 
172 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>