25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2508 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
354 aa  676    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  38.57 
 
 
359 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  33.99 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  35.55 
 
 
344 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  28.09 
 
 
291 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  28.66 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  30.28 
 
 
327 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  31.43 
 
 
330 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  28.25 
 
 
322 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  26.35 
 
 
322 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  26.41 
 
 
295 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  27.91 
 
 
301 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  26.17 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  26.1 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  30.29 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  30.55 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  26.71 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  29.6 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  28.32 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  21 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  23.76 
 
 
774 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  28.37 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  32.98 
 
 
149 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>