35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1060 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
365 aa  731    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  56.79 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  50.81 
 
 
359 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  40.29 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  39.53 
 
 
291 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  41.74 
 
 
322 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  35.34 
 
 
293 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  37.32 
 
 
323 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  38.79 
 
 
322 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  36.44 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  37.18 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  35.53 
 
 
329 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  29.02 
 
 
295 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  32.08 
 
 
410 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  32.65 
 
 
327 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  37.04 
 
 
329 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  32.08 
 
 
330 aa  152  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  32.58 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  30.03 
 
 
328 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  30.26 
 
 
337 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  32.83 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  29.63 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  26.76 
 
 
774 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  25.76 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  45.56 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  26.51 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  41.67 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  27.64 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  25.13 
 
 
170 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  25.16 
 
 
303 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  29.01 
 
 
215 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  33.77 
 
 
181 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  34.72 
 
 
174 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  32.47 
 
 
181 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>