39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1143 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  608  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  57.73 
 
 
293 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  61.81 
 
 
291 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  53.66 
 
 
295 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  48.53 
 
 
322 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  49.49 
 
 
322 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  40.29 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  45.95 
 
 
329 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  43.1 
 
 
323 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  218  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  40.06 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  41.72 
 
 
329 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  39.36 
 
 
359 aa  208  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  49.75 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  35.15 
 
 
774 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  57.14 
 
 
171 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  27.53 
 
 
410 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  33.33 
 
 
273 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  30.37 
 
 
337 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  26.86 
 
 
330 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  27.62 
 
 
328 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  32.13 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  26.19 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  34.94 
 
 
170 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  35.51 
 
 
215 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  28.01 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  48.91 
 
 
186 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  34.24 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  25.35 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  56.92 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  41.56 
 
 
181 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  29.92 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  34.54 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  27.04 
 
 
1124 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  30.43 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  42.31 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  35.42 
 
 
172 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0392  hypothetical protein  30.61 
 
 
726 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>