18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1319 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  52.63 
 
 
181 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  51.46 
 
 
181 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  35.14 
 
 
215 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  35.96 
 
 
329 aa  103  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  48.28 
 
 
329 aa  64.7  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  30.43 
 
 
301 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  37.25 
 
 
293 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  24.53 
 
 
322 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  26.47 
 
 
323 aa  58.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  33.65 
 
 
291 aa  57.8  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  25.45 
 
 
170 aa  57.4  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  28.08 
 
 
322 aa  57.4  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  35.87 
 
 
325 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  34.72 
 
 
365 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  35.37 
 
 
329 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  32.67 
 
 
295 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  34.57 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>