38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1145 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  594  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  57.73 
 
 
301 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  53.17 
 
 
291 aa  309  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  51.02 
 
 
295 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  42.71 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  41.39 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  38.46 
 
 
325 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  35.34 
 
 
365 aa  208  8e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  36.13 
 
 
359 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  37.46 
 
 
323 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  37.25 
 
 
329 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  38.62 
 
 
329 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  35.89 
 
 
344 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  36.57 
 
 
329 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  32.52 
 
 
774 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  25.63 
 
 
410 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  45.52 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  33.07 
 
 
273 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  35.15 
 
 
170 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  25.97 
 
 
354 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  25.91 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  25.31 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  36.19 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  25.86 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  30.88 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  47.06 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  46.58 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  40.45 
 
 
181 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  22.46 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  26.83 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  25.78 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  26.84 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  42.35 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  29.13 
 
 
1124 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  28.5 
 
 
252 aa  60.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  37.25 
 
 
174 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0339  hypothetical protein  29.27 
 
 
258 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>