37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0822 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
329 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  46.23 
 
 
322 aa  311  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  50.32 
 
 
329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  48.61 
 
 
322 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  42.9 
 
 
325 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  45.54 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  41.72 
 
 
301 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  41.46 
 
 
291 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  37.25 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  37.18 
 
 
365 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  35.93 
 
 
329 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  34.2 
 
 
359 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  34.63 
 
 
344 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  36.12 
 
 
295 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  38.41 
 
 
170 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  26.86 
 
 
774 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  26.32 
 
 
410 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  30.56 
 
 
327 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  27.51 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  26.07 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  32.93 
 
 
215 aa  90.1  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  25.57 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  24.05 
 
 
330 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  27.23 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  28.03 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  48.53 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  26.3 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  28.35 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  27.48 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  33.58 
 
 
171 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  25.82 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  37.93 
 
 
149 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  31.73 
 
 
174 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  32.69 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0339  hypothetical protein  27.2 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>