27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0338 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  100 
 
 
149 aa  277  3e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  50.41 
 
 
186 aa  119  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  50.59 
 
 
325 aa  92  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  48.84 
 
 
329 aa  92  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  47.75 
 
 
322 aa  90.9  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  51.76 
 
 
322 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  51.19 
 
 
291 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  51.81 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  42.45 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  54.67 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  42.86 
 
 
323 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  36.79 
 
 
329 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  42.35 
 
 
293 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  35.83 
 
 
359 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  42.22 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  39.29 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  32.43 
 
 
774 aa  58.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  39.02 
 
 
273 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  32.8 
 
 
328 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  40.86 
 
 
322 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  33 
 
 
327 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  39.62 
 
 
252 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  43.1 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  31.52 
 
 
354 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  36 
 
 
328 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  31.48 
 
 
330 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  37 
 
 
303 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>