18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1083 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  503  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  28.17 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  28.99 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  29.84 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  28.43 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  27.2 
 
 
322 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  24.73 
 
 
774 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  23.75 
 
 
323 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  34.55 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  60.42 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  32.5 
 
 
325 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  24.69 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  27.16 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  23.63 
 
 
329 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  29.46 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  39.62 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  36.67 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  23.08 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>