36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0392 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 		 322 aa  650    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  59.34 
 
 		 322 aa  363  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  50.78 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  53.97 
 
 		 329 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  48.88 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  46.23 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  48.53 
 
 		 301 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  46.41 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  41.39 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  38.79 
 
 		 365 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  41.51 
 
 		 329 aa  202  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  39.57 
 
 		 344 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  38.82 
 
 		 295 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  36.34 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  33.55 
 
 		 774 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  40.49 
 
 		 170 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  27.73 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  33.12 
 
 		 181 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  31.89 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  26.13 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  55.84 
 
 		 186 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  29.77 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  29.96 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  26.04 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  32.48 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  27.67 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  60 
 
 		 149 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  26.86 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  27.61 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  23.25 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  24.53 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  42.37 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  33.02 
 
 		 171 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>