20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0595 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  87.29 
 
 
181 aa  324  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  51.46 
 
 
174 aa  188  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  43.23 
 
 
215 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  40.66 
 
 
329 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  33.99 
 
 
323 aa  93.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  32.48 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  32.22 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  27.1 
 
 
322 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  46.58 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  30.29 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  40 
 
 
301 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  39.33 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  32.14 
 
 
329 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  30.53 
 
 
329 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  29.59 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  32.47 
 
 
365 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  34.21 
 
 
295 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  32.47 
 
 
344 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  38.98 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>