36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1212 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
359 aa  706    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  59.38 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  50.81 
 
 
365 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  40.82 
 
 
291 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  39.36 
 
 
301 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  36.13 
 
 
293 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  40.4 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  35.45 
 
 
323 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  36.34 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  33.62 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  34.2 
 
 
325 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  37.35 
 
 
354 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  34.3 
 
 
410 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  34.2 
 
 
329 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  34.2 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  29.9 
 
 
329 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  29.33 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  29.74 
 
 
327 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  32.56 
 
 
328 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  29.75 
 
 
328 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  29.66 
 
 
774 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  31.03 
 
 
337 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  32.48 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  33.75 
 
 
186 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  25.73 
 
 
170 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  36.27 
 
 
149 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  24.82 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  28.33 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  25.17 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  27.6 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  33.77 
 
 
181 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  35.06 
 
 
181 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  21.54 
 
 
215 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  31.68 
 
 
171 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  34.72 
 
 
174 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0015  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.59 
 
 
550 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>