34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0062 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
344 aa  681    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  56.79 
 
 
365 aa  374  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  59.38 
 
 
359 aa  359  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  40.87 
 
 
291 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  40.06 
 
 
301 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  39.57 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  41.9 
 
 
322 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  38.48 
 
 
325 aa  205  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  38.48 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  35.89 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  37 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  32.92 
 
 
410 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  34.25 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  33.43 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  33.73 
 
 
327 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  34.08 
 
 
329 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  33.85 
 
 
354 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  33.73 
 
 
328 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  32.64 
 
 
328 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  32.52 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  29.63 
 
 
774 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  35.23 
 
 
322 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  30.89 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  42.48 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  31.19 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  45.12 
 
 
149 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  30.94 
 
 
171 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  23.7 
 
 
170 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  23.48 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  31.08 
 
 
172 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>