26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0200 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  598  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  79.47 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  72.85 
 
 
303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  29.77 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  29.76 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  31.87 
 
 
325 aa  85.9  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  33.93 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  32.07 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  32.46 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  31.27 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  29.92 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  26.85 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  26.84 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  26.01 
 
 
774 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  29.73 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  26.61 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  31.69 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  24.04 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  25.42 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  23.51 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  35.8 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  29.3 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  40.58 
 
 
186 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  27.84 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  46.43 
 
 
149 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>