22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0602 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  346  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  51.01 
 
 
301 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  43.92 
 
 
295 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  44.67 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  37.16 
 
 
291 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  30.36 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  32.34 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  47.5 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  28.42 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  30.95 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  30.12 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  33.58 
 
 
329 aa  64.7  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  32.45 
 
 
774 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  43.04 
 
 
329 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  30.12 
 
 
322 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  30.6 
 
 
329 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  47.46 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  29.59 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  30 
 
 
359 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  28.57 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  27.97 
 
 
273 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>