20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1358 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  87.29 
 
 
181 aa  324  3e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  52.63 
 
 
174 aa  193  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  40.22 
 
 
329 aa  131  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  35.06 
 
 
323 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  33.12 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  28.89 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  29.03 
 
 
322 aa  78.2  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  41.57 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  40.45 
 
 
293 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  41.56 
 
 
301 aa  72  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  42.05 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  44.87 
 
 
329 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  31.25 
 
 
329 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  47.46 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  33.77 
 
 
365 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  34.88 
 
 
295 aa  47.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  37.68 
 
 
774 aa  44.3  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  40.68 
 
 
359 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>