25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2087 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
170 aa  343  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  41.57 
 
 
322 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  40.49 
 
 
322 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  42.42 
 
 
325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  40.88 
 
 
329 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  43.97 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  36.97 
 
 
323 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  34.94 
 
 
301 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  35.15 
 
 
293 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  34.52 
 
 
295 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  35.19 
 
 
215 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  31.33 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  32.22 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  28.89 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  26.9 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  30.97 
 
 
774 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  25.13 
 
 
365 aa  64.3  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  32.84 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  23.7 
 
 
344 aa  60.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  25.45 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  25.85 
 
 
359 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  24.83 
 
 
328 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  26.71 
 
 
327 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  27.62 
 
 
273 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  26.42 
 
 
330 aa  40.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>