23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3441 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  100 
 
 
410 aa  805    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  37.92 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  32.96 
 
 
365 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  32.73 
 
 
344 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  33.72 
 
 
359 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  33.94 
 
 
337 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  27.44 
 
 
301 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  26.5 
 
 
295 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  31.48 
 
 
330 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  27.43 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  25.63 
 
 
293 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  24.92 
 
 
291 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  26.9 
 
 
774 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  25.38 
 
 
325 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  29.32 
 
 
327 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  26.99 
 
 
329 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  26.67 
 
 
322 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  25 
 
 
329 aa  94  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  25.79 
 
 
329 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  24.69 
 
 
323 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  29.93 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  29.39 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  27.3 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>