27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3972 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 993 aa  1991    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.12 
 
 		 1292 aa  92.8  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.46 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  33.15 
 
 		 623 aa  73.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.69 
 
 		 1057 aa  73.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.76 
 
 		 2656 aa  58.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  30.59 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  30.6 
 
 		 1146 aa  55.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.63 
 
 		 2272 aa  54.3  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  34.19 
 
 		 917 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.93 
 
 		 734 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  31.98 
 
 		 1150 aa  52.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  36.22 
 
 		 563 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0815  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1124 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.676426  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.24 
 
 		 406 aa  50.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  33.08 
 
 		 634 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  32.85 
 
 		 1565 aa  48.9  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.84 
 
 		 575 aa  48.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2169 aa  48.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  23.66 
 
 		 1300 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.49 
 
 		 3197 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  35.34 
 
 		 1151 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.01 
 
 		 3197 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  28.95 
 
 		 985 aa  45.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  25.44 
 
 		 1152 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  26.94 
 
 		 4465 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  27.1 
 
 		 792 aa  45.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>