19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5589 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  100 
 
 
1292 aa  2571    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3972  PKD domain-containing protein  24.12 
 
 
993 aa  94.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  34.04 
 
 
2066 aa  57  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  28.31 
 
 
747 aa  57.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.57 
 
 
4761 aa  55.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.65 
 
 
1367 aa  54.3  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.09 
 
 
4433 aa  51.6  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  36.14 
 
 
4357 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.95 
 
 
1679 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1692  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  24.77 
 
 
523 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.363459  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1759  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.03 
 
 
571 aa  50.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00340531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  33.08 
 
 
3507 aa  50.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2261  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  33.77 
 
 
647 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00906111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
420 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
643 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  29.81 
 
 
1576 aa  47  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.1 
 
 
574 aa  47.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0083  LamG domain-containing protein  29.44 
 
 
430 aa  46.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.97 
 
 
1424 aa  44.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>