61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3556 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  100 
 
 
358 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  58 
 
 
393 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  43.22 
 
 
537 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  44.51 
 
 
540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  37.99 
 
 
543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  36.83 
 
 
1194 aa  187  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  40.07 
 
 
507 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  38.26 
 
 
539 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  37.74 
 
 
504 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
449 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  37.42 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  36.91 
 
 
451 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  36.81 
 
 
401 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  37.74 
 
 
451 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  36.91 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  37.42 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  36.91 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  37.13 
 
 
451 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  37.76 
 
 
562 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  35.18 
 
 
686 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  35.18 
 
 
686 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  35.47 
 
 
2305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  35.18 
 
 
897 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  35.18 
 
 
897 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  35.18 
 
 
897 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  37.54 
 
 
751 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.74 
 
 
623 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  40.93 
 
 
2310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  33.82 
 
 
593 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  33.45 
 
 
665 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  34.08 
 
 
481 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  32.46 
 
 
324 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  32.63 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  36.29 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  32.96 
 
 
426 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.92 
 
 
526 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  28.81 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.17 
 
 
338 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  33.2 
 
 
465 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.09 
 
 
452 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  31.33 
 
 
358 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.9 
 
 
490 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  27.4 
 
 
597 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  26.13 
 
 
561 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  29.64 
 
 
421 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  27.54 
 
 
548 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  27.8 
 
 
591 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  28.21 
 
 
514 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  30.08 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  25.24 
 
 
552 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  26.32 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
671 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  28.34 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  26.59 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  25.94 
 
 
521 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  28.25 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>