81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5623 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  100 
 
 		 426 aa  849    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  37.89 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  38.56 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  37.53 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  35.78 
 
 		 504 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  38.5 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  38.14 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  38.14 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  37.63 
 
 		 451 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  35.31 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  36.22 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  41.69 
 
 		 507 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  40.8 
 
 		 539 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  40.85 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  38.65 
 
 		 2305 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  39.53 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  38.49 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  37.46 
 
 		 751 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  36.36 
 
 		 1194 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  30.85 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  32.22 
 
 		 591 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  35.81 
 
 		 665 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  35.81 
 
 		 593 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  38.18 
 
 		 2310 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  32.34 
 
 		 562 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  34.08 
 
 		 686 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  34.08 
 
 		 897 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  34.08 
 
 		 686 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  33.76 
 
 		 897 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  33.76 
 
 		 897 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.59 
 
 		 623 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  35.22 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  34.82 
 
 		 597 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  29.37 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  30.28 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  33.33 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.07 
 
 		 324 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  31.83 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.82 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  30.77 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  29.72 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  31.27 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  28.52 
 
 		 552 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  31.25 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.98 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 671 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  30.03 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  30.4 
 
 		 540 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  33.1 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.94 
 
 		 537 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  28.89 
 
 		 548 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  30.12 
 
 		 365 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  25 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  61.7 
 
 		 672 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  25.45 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  25.94 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  55.56 
 
 		 675 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 904 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  47.17 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  39.22 
 
 		 772 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  39.62 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  41.38 
 
 		 729 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  41.38 
 
 		 729 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  30.77 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  37.88 
 
 		 1057 aa  46.6  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  43.14 
 
 		 855 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.07 
 
 		 855 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  39.22 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  36.54 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  38.33 
 
 		 600 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.54 
 
 		 626 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  43.14 
 
 		 763 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.8 
 
 		 647 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>