156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003394 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  100 
 
 		 443 aa  909    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  33.96 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  31.25 
 
 		 660 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  31.49 
 
 		 548 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  37.12 
 
 		 268 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.97 
 
 		 552 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.89 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 650 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.83 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.19 
 
 		 243 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  32.93 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  36.44 
 
 		 249 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  37.28 
 
 		 607 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 247 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 		 494 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.77 
 
 		 275 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  36.61 
 
 		 262 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 		 841 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.86 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.46 
 
 		 272 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.95 
 
 		 843 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.65 
 
 		 249 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  27.84 
 
 		 702 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  29.68 
 
 		 543 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.92 
 
 		 307 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.72 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  32.28 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  29.76 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  32.71 
 
 		 209 aa  96.3  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 554 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  30.1 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  29.83 
 
 		 558 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.71 
 
 		 288 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.15 
 
 		 270 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.81 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  29.18 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  31.34 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  27.82 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  42.42 
 
 		 848 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  28.31 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  53.85 
 
 		 855 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  45.71 
 
 		 729 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  45.71 
 
 		 729 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  45.61 
 
 		 848 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  24.53 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2687  conserved repeat domain protein  30.69 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000153291  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  40.21 
 
 		 1242 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 727 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  50 
 
 		 699 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  27 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.57 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.46 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  60 
 
 		 639 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  58.14 
 
 		 1331 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_7679  predicted protein  41.28 
 
 		 105 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45961  predicted protein  24.35 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  49.02 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  53.85 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  43.4 
 
 		 651 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  28.46 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.27 
 
 		 669 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  46.67 
 
 		 772 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  50 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  48.98 
 
 		 1577 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  30.22 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.75 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  53.49 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.64 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.21 
 
 		 277 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.52 
 
 		 699 aa  53.5  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  56.1 
 
 		 623 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.5 
 
 		 816 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  44.19 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  50 
 
 		 574 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.91 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.91 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.45 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  51.22 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  51.28 
 
 		 1057 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.49 
 
 		 255 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 591 aa  50.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  48.84 
 
 		 1054 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 290 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  48.84 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 279 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  41.86 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.09 
 
 		 713 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  47.83 
 
 		 763 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  41.86 
 
 		 1127 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  51.11 
 
 		 675 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  46.67 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  41.86 
 
 		 1127 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>