48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7679 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_7679  predicted protein  100 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  49.52 
 
 
607 aa  101  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  50.47 
 
 
558 aa  99.8  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  48.15 
 
 
508 aa  90.5  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47 
 
 
272 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  52.27 
 
 
543 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  45.87 
 
 
660 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  40 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.67 
 
 
554 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  41.82 
 
 
582 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.59 
 
 
494 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.01 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.29 
 
 
427 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  39.62 
 
 
262 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.35 
 
 
261 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  51.56 
 
 
702 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 
270 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 
247 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38 
 
 
249 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37 
 
 
841 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.61 
 
 
552 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.91 
 
 
275 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 
275 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  41.28 
 
 
443 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 
843 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 
650 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.21 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45961  predicted protein  32.48 
 
 
366 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.55 
 
 
259 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  41.44 
 
 
538 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.82 
 
 
440 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  34.19 
 
 
399 aa  53.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  48.33 
 
 
298 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.94 
 
 
474 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.64 
 
 
307 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  43.55 
 
 
548 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 
432 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004369  secreted trypsin-like serine protease  30.77 
 
 
388 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  36.7 
 
 
403 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  39.13 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.58 
 
 
467 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  40.3 
 
 
333 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  45.45 
 
 
323 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  40.3 
 
 
379 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.03 
 
 
277 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  35.42 
 
 
330 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>