34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1599 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  100 
 
 
445 aa  923    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  50 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  50 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  47.06 
 
 
772 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  46.15 
 
 
451 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.51 
 
 
669 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  37.04 
 
 
675 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  48.84 
 
 
443 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  46 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
449 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  46 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  46 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  58.33 
 
 
504 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  42 
 
 
855 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.67 
 
 
1057 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  43.14 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  40 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  45.24 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  42.86 
 
 
481 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  39.22 
 
 
420 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  42.31 
 
 
651 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.17 
 
 
816 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  58.06 
 
 
699 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  41.67 
 
 
392 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  23.78 
 
 
289 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 
904 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  41.3 
 
 
868 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>