107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7196 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  100 
 
 		 367 aa  731    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  95.5 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  60.18 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  58.21 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  62.98 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  55.88 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  61.76 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  64.22 
 
 		 245 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  59.45 
 
 		 295 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  52.43 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  52.43 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  52.43 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  39.29 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  31.66 
 
 		 709 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  52.44 
 
 		 675 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  70.21 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  29.34 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  27.35 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  27.35 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  27.35 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  27.35 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  27.35 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  62.22 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  29.35 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  48.08 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  47.17 
 
 		 591 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  33.56 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  33.56 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  33.09 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  32.33 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  36.27 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  27.39 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  32.71 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  50 
 
 		 848 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  52.73 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  54 
 
 		 855 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  27.8 
 
 		 183 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  58.7 
 
 		 868 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  54.35 
 
 		 868 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4092  hypothetical protein  30.81 
 
 		 588 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  54.17 
 
 		 772 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  54.35 
 
 		 868 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  56.52 
 
 		 868 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  56.52 
 
 		 868 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  26.53 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  27.8 
 
 		 566 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  29.02 
 
 		 567 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.38 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  46.67 
 
 		 1057 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  54.35 
 
 		 867 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 727 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  54.35 
 
 		 868 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  44 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.43 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  50 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  53.49 
 
 		 869 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 863 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  41.77 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  40.68 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  40.51 
 
 		 451 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  40.51 
 
 		 451 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  39.24 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  33.73 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  54.29 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  37.97 
 
 		 504 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  54.29 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.22 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  39.29 
 
 		 600 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  44.9 
 
 		 985 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  31.01 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  41.18 
 
 		 848 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  25.7 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  25.7 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  40 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  38.27 
 
 		 1362 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  40.32 
 
 		 651 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  51.43 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  46.15 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  42.86 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  44.68 
 
 		 816 aa  46.2  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  41.67 
 
 		 855 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  34.62 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  30.36 
 
 		 964 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  32.48 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  24.87 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  42.86 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>