205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2229 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 468 aa  952    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  53.08 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  48.89 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  59.7 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  47.94 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  48.98 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  52.53 
 
 		 543 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  51.86 
 
 		 561 aa  326  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  43.97 
 
 		 478 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  51.17 
 
 		 523 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.47 
 
 		 507 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  42.32 
 
 		 1294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  42.32 
 
 		 1414 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  46.57 
 
 		 1369 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  26.76 
 
 		 732 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  27.89 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  37.77 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.85 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  55.56 
 
 		 900 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  56.38 
 
 		 655 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  55.42 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  47.37 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  44.68 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  38.71 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  50 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  44.57 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  50 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  43.3 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  53.57 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  47.73 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.49 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  43.37 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  43.48 
 
 		 854 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  52.33 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  50.55 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  41.49 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.67 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  47.47 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  48.78 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  47.62 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45.24 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  43.53 
 
 		 913 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  46.43 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  43.96 
 
 		 792 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  40.91 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  28 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.29 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  43.82 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.32 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  45.74 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  44.57 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.19 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  43.88 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  36.08 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  38.37 
 
 		 925 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  43.96 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 846 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  35.56 
 
 		 756 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  25.99 
 
 		 850 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  31.14 
 
 		 600 aa  65.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  39.77 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  41.3 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  48.15 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  40.43 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35.79 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  45.78 
 
 		 690 aa  63.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  45.78 
 
 		 854 aa  63.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.86 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.86 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  38.61 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  42.7 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  46.48 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  40 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  35.44 
 
 		 842 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  38.24 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  37.35 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  37.62 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.35 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  37.21 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.68 
 
 		 875 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  46.48 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  40.51 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  38.75 
 
 		 894 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  38.55 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 854 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.98 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  40.74 
 
 		 596 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 1128 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  41.67 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  37.5 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  34.04 
 
 		 613 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>