210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0379 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  100 
 
 
732 aa  1500    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  58.51 
 
 
558 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  33.55 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.72 
 
 
756 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.8 
 
 
507 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  28.4 
 
 
543 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.8 
 
 
637 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  28.17 
 
 
445 aa  130  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  30.45 
 
 
403 aa  126  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  26.6 
 
 
468 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.35 
 
 
453 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  26.87 
 
 
449 aa  121  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  40.74 
 
 
850 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.73 
 
 
985 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 
953 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  44 
 
 
755 aa  117  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 
1007 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.2 
 
 
962 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  42.74 
 
 
987 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  42.06 
 
 
392 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  40.46 
 
 
578 aa  114  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.95 
 
 
674 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  28.57 
 
 
460 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  26.38 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  43.2 
 
 
433 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.74 
 
 
929 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.75 
 
 
722 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  42.45 
 
 
571 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  42.4 
 
 
449 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  44 
 
 
819 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.06 
 
 
581 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.28 
 
 
639 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.51 
 
 
578 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  40.29 
 
 
1441 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44 
 
 
1158 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.54 
 
 
971 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  41.91 
 
 
999 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 
752 aa  104  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.65 
 
 
815 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  43.7 
 
 
801 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  43.2 
 
 
588 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 
940 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.86 
 
 
1321 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.08 
 
 
1581 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  46.46 
 
 
452 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.92 
 
 
915 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  27.74 
 
 
478 aa  99  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.48 
 
 
1117 aa  97.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  40.88 
 
 
1059 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  39.37 
 
 
1070 aa  97.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  45.87 
 
 
1338 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  26.25 
 
 
1294 aa  94.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2128  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.72 
 
 
857 aa  94  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00114643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  26.25 
 
 
1414 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  26.25 
 
 
1369 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.09 
 
 
729 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 
1332 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.32 
 
 
1564 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.42 
 
 
1362 aa  90.5  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.68 
 
 
984 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  36.69 
 
 
4013 aa  87.8  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  32 
 
 
478 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  39.68 
 
 
1103 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  39.68 
 
 
1059 aa  84.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  39.84 
 
 
879 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  56.06 
 
 
646 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  28.21 
 
 
850 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.02 
 
 
1139 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.75 
 
 
695 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  36.43 
 
 
1028 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.92 
 
 
722 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.64 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  41.75 
 
 
470 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  29.58 
 
 
1471 aa  72  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  40.18 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.81 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  38.83 
 
 
487 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.83 
 
 
487 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  34.17 
 
 
873 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  28.32 
 
 
949 aa  67.4  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.58 
 
 
1060 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
683 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  53.12 
 
 
536 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0728  cellulosome anchoring protein cohesin region  40.57 
 
 
1546 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.38 
 
 
538 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  33.81 
 
 
2117 aa  64.7  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.83 
 
 
470 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
541 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.86 
 
 
472 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  46.15 
 
 
560 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
820 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  39.24 
 
 
391 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
961 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.86 
 
 
472 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.83 
 
 
470 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  43.9 
 
 
861 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  36.26 
 
 
532 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  46.27 
 
 
621 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  39.13 
 
 
567 aa  61.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  44.12 
 
 
423 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>