161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0755 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  63.34 
 
 
649 aa  848    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
646 aa  1332    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  34.5 
 
 
578 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.69 
 
 
582 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  31.39 
 
 
885 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  32.15 
 
 
591 aa  273  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  34.61 
 
 
854 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  32.57 
 
 
587 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  32.32 
 
 
571 aa  265  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  31.25 
 
 
874 aa  258  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
895 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  30.53 
 
 
537 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  29.8 
 
 
1100 aa  228  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  31.75 
 
 
775 aa  218  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.03 
 
 
927 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 
812 aa  210  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  28.89 
 
 
833 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  32.17 
 
 
875 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.97 
 
 
998 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.23 
 
 
867 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  30.07 
 
 
864 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
1224 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  30.8 
 
 
851 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.73 
 
 
762 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  28.43 
 
 
1105 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.75 
 
 
786 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.5 
 
 
611 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.25 
 
 
900 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
1601 aa  172  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  25.88 
 
 
526 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 
606 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
632 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.24 
 
 
621 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  23.85 
 
 
803 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 
611 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  25.8 
 
 
815 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.61 
 
 
1076 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  24.72 
 
 
978 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  29.52 
 
 
665 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  25.54 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.01 
 
 
2042 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.06 
 
 
906 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 
961 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  56.06 
 
 
732 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 
710 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 
742 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  24.85 
 
 
949 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  45.56 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.47 
 
 
887 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 
707 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  24.6 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  50 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  45.33 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  52.86 
 
 
873 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  24.15 
 
 
730 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  43.27 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
739 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  23.66 
 
 
686 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  23.81 
 
 
984 aa  67.4  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  40 
 
 
560 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  39.02 
 
 
539 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 
736 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  50.75 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  47.95 
 
 
536 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  56.45 
 
 
955 aa  65.1  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
541 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 
424 aa  64.7  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  24.65 
 
 
880 aa  64.3  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  39.09 
 
 
778 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  24.75 
 
 
725 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  37.78 
 
 
567 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  39.22 
 
 
990 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.05 
 
 
985 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 
679 aa  62.4  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
746 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  32.81 
 
 
928 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  24.03 
 
 
847 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  46.77 
 
 
1015 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.43 
 
 
554 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  48.44 
 
 
951 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  45.71 
 
 
295 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 
837 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  48.65 
 
 
861 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  53.03 
 
 
435 aa  60.5  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.16 
 
 
533 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  42.35 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 
509 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  41.43 
 
 
303 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
846 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  46.97 
 
 
737 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  49.15 
 
 
965 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 
683 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  50.88 
 
 
604 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.37 
 
 
469 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  50.85 
 
 
1122 aa  58.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  45.31 
 
 
524 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  38.6 
 
 
482 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  22.1 
 
 
928 aa  58.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  44.71 
 
 
308 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>