143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0734 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
737 aa  1528    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.81 
 
 
846 aa  553  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  47.69 
 
 
880 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  48.3 
 
 
847 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  47.79 
 
 
794 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  42.12 
 
 
730 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  45.25 
 
 
990 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  43.73 
 
 
725 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  41.04 
 
 
739 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  40.74 
 
 
715 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  39.27 
 
 
742 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  39.9 
 
 
736 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.97 
 
 
887 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  42.34 
 
 
1759 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 
1137 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  42.22 
 
 
1017 aa  455  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  40.29 
 
 
1369 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.29 
 
 
985 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  36.66 
 
 
710 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 
707 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  34.72 
 
 
757 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  35.6 
 
 
686 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  30.97 
 
 
949 aa  320  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 
961 aa  303  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
789 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  28.55 
 
 
778 aa  279  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  33.86 
 
 
526 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 
928 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  30 
 
 
984 aa  276  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.44 
 
 
854 aa  261  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 
894 aa  258  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  33.03 
 
 
611 aa  256  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  28.65 
 
 
590 aa  165  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  27.49 
 
 
978 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  26.55 
 
 
2042 aa  129  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  58.33 
 
 
722 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  44.71 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  57.14 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  57.41 
 
 
584 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  49.23 
 
 
477 aa  64.3  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  50 
 
 
955 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  46.97 
 
 
536 aa  63.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  56.9 
 
 
460 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  45.35 
 
 
885 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  50 
 
 
298 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  58.33 
 
 
490 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  22.22 
 
 
874 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  48.61 
 
 
951 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  49.18 
 
 
552 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0739  cellulosome protein dockerin type I  43.06 
 
 
676 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000588173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  48.39 
 
 
482 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  51.61 
 
 
295 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  51.79 
 
 
462 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  20.84 
 
 
591 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  46.97 
 
 
646 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 
746 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
780 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  47.83 
 
 
873 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  51.72 
 
 
524 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  41.33 
 
 
583 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
541 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  46.15 
 
 
475 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 
604 aa  57  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  48.33 
 
 
436 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  23.44 
 
 
623 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  51.85 
 
 
308 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  39.39 
 
 
423 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  47.76 
 
 
509 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 
1122 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  21.72 
 
 
537 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  44.12 
 
 
948 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.88 
 
 
582 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
895 aa  55.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  49.23 
 
 
833 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  42.59 
 
 
621 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 
773 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  39.74 
 
 
570 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  21.7 
 
 
1601 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  43.55 
 
 
1209 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
807 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  45.16 
 
 
303 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.49 
 
 
649 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
580 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1015 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  23.21 
 
 
812 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  49.09 
 
 
435 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  44.62 
 
 
861 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 
477 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 
1224 aa  52  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  23.2 
 
 
587 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  48.33 
 
 
311 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  37.36 
 
 
471 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 
619 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  39.68 
 
 
630 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  44.83 
 
 
532 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  42.62 
 
 
577 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  42.86 
 
 
425 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  29.2 
 
 
875 aa  50.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
535 aa  50.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>