122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0753 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  67.56 
 
 
789 aa  1103    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  69.62 
 
 
611 aa  789    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
778 aa  1615    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  38.51 
 
 
757 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  41.29 
 
 
928 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  37.15 
 
 
961 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  37.45 
 
 
949 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  37.28 
 
 
984 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  37.98 
 
 
854 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  36.48 
 
 
894 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
707 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  35.23 
 
 
686 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  34.54 
 
 
725 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  32.47 
 
 
736 aa  323  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
710 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
730 aa  317  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.52 
 
 
887 aa  313  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  35.96 
 
 
526 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  36.8 
 
 
563 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 
739 aa  300  8e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  32.83 
 
 
1759 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  30.96 
 
 
742 aa  291  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  30.49 
 
 
715 aa  286  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  29.17 
 
 
737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  31.28 
 
 
880 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  31.21 
 
 
794 aa  278  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.71 
 
 
847 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  31.09 
 
 
1369 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  31.49 
 
 
846 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
1137 aa  259  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.89 
 
 
985 aa  258  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  30.01 
 
 
990 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  28.84 
 
 
1017 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.78 
 
 
2042 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.28 
 
 
978 aa  117  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  25.44 
 
 
590 aa  117  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
1601 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  25.97 
 
 
591 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 
895 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  25.27 
 
 
885 aa  71.2  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  21.9 
 
 
537 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  54.1 
 
 
833 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0920  cellulosome protein dockerin type I  51.61 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  25.87 
 
 
854 aa  67.4  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  26.4 
 
 
571 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  24.57 
 
 
874 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0736  cellulosome protein dockerin type I  46.77 
 
 
424 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00031925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  23.29 
 
 
649 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  34.35 
 
 
298 aa  65.1  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  39.09 
 
 
646 aa  64.7  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
1224 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  54.39 
 
 
837 aa  61.6  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.49 
 
 
927 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  47.76 
 
 
541 aa  61.6  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  48.39 
 
 
780 aa  61.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.7 
 
 
582 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  49.25 
 
 
536 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.42 
 
 
423 aa  58.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.32 
 
 
867 aa  57.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.41 
 
 
611 aa  57.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  50 
 
 
577 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  45.76 
 
 
928 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  40.24 
 
 
679 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.28 
 
 
511 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  32.23 
 
 
567 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  44.93 
 
 
535 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  38.82 
 
 
558 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1015 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  27.84 
 
 
587 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 
604 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  39.39 
 
 
477 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  47.37 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  43.1 
 
 
533 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  42.65 
 
 
873 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  43.08 
 
 
746 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  47.62 
 
 
707 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
1077 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.54 
 
 
554 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.94 
 
 
786 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  38.89 
 
 
539 aa  53.5  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.85 
 
 
900 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40.54 
 
 
732 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  43.06 
 
 
951 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 
1122 aa  51.6  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  22.88 
 
 
1100 aa  51.2  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 
683 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  25.87 
 
 
812 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  40.35 
 
 
965 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  41.94 
 
 
722 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  44.44 
 
 
460 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  21.67 
 
 
623 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  43.08 
 
 
303 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  23.05 
 
 
578 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.67 
 
 
469 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  38.71 
 
 
630 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.72 
 
 
762 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  31.85 
 
 
775 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.78 
 
 
998 aa  48.9  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  42.62 
 
 
955 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  45.76 
 
 
435 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>