150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0578 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  61.79 
 
 		 1759 aa  824    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.48 
 
 		 887 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  58.7 
 
 		 739 aa  865    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 736 aa  1525    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  49.53 
 
 		 710 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  61.16 
 
 		 730 aa  894    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  60.45 
 
 		 985 aa  835    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  56.15 
 
 		 1369 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  56.55 
 
 		 725 aa  790    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.54 
 
 		 846 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  50.77 
 
 		 880 aa  591  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  42.73 
 
 		 742 aa  562  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  44.26 
 
 		 794 aa  540  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  42.32 
 
 		 715 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  47.67 
 
 		 990 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.84 
 
 		 847 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  40.67 
 
 		 707 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  39.9 
 
 		 737 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 		 1137 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  40.24 
 
 		 1017 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  37.89 
 
 		 686 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 789 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  33.21 
 
 		 757 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 		 961 aa  336  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  38.91 
 
 		 526 aa  336  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.38 
 
 		 984 aa  330  6e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 		 928 aa  330  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  40.75 
 
 		 563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  32.47 
 
 		 778 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  30.86 
 
 		 949 aa  326  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.81 
 
 		 854 aa  308  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 894 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  34.98 
 
 		 611 aa  280  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  28.65 
 
 		 978 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.92 
 
 		 2042 aa  164  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  32.87 
 
 		 590 aa  130  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 		 591 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.48 
 
 		 842 aa  91.3  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  46.88 
 
 		 334 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.25 
 
 		 831 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  53.85 
 
 		 415 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  49.02 
 
 		 922 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.88 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  46.08 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  23.97 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  44.95 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  24.11 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.1 
 
 		 790 aa  84  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 		 649 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  51.35 
 
 		 814 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  25.21 
 
 		 885 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  24.04 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  46.67 
 
 		 900 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  52.78 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  44.3 
 
 		 948 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 1224 aa  74.3  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 		 773 aa  73.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.75 
 
 		 707 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.22 
 
 		 867 aa  73.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  46.48 
 
 		 600 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  40.23 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  52.56 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  50.72 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  50 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.05 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  47.14 
 
 		 982 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 660 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 895 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 741 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  48.61 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.3 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.93 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  45.59 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.47 
 
 		 807 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  47.83 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.89 
 
 		 350 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.07 
 
 		 423 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  22.63 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.24 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.57 
 
 		 710 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 		 1601 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.89 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 1077 aa  65.1  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.58 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  52.11 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  49.28 
 
 		 837 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.39 
 
 		 528 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  40.85 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.11 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  37.5 
 
 		 873 aa  60.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  38.67 
 
 		 435 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>