284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0661 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  100 
 
 		 571 aa  1179    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  55.46 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.81 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  41.06 
 
 		 1197 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  37.84 
 
 		 369 aa  216  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  37.09 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  39.8 
 
 		 325 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  33.79 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  46.1 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  30.4 
 
 		 488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1278 aa  123  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.36 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  41.73 
 
 		 691 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  43.07 
 
 		 507 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  44.53 
 
 		 507 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.53 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  42.47 
 
 		 789 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  45.99 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  26.88 
 
 		 510 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.55 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  30.14 
 
 		 422 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.36 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  40.71 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40.58 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  43.17 
 
 		 1139 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  39.58 
 
 		 497 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40.91 
 
 		 436 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  37.76 
 
 		 1413 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  40.74 
 
 		 491 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  41.55 
 
 		 647 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.61 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  36.96 
 
 		 897 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.39 
 
 		 943 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  40.14 
 
 		 411 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.03 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  41.43 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.44 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  37.86 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  28.12 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  37.06 
 
 		 884 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.87 
 
 		 503 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  35.66 
 
 		 957 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.72 
 
 		 472 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.04 
 
 		 507 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  55.17 
 
 		 707 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.12 
 
 		 618 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  26.99 
 
 		 360 aa  94  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  39.42 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.21 
 
 		 737 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.06 
 
 		 476 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  53.75 
 
 		 619 aa  90.9  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  36.23 
 
 		 771 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.87 
 
 		 615 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.96 
 
 		 1259 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  56 
 
 		 591 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 537 aa  87.8  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.56 
 
 		 672 aa  87.4  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  53.16 
 
 		 842 aa  87  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  64.62 
 
 		 611 aa  87  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  59.42 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  49.33 
 
 		 736 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  30.5 
 
 		 963 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  24.19 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  37.06 
 
 		 2073 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  48.24 
 
 		 334 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.46 
 
 		 695 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  34.33 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  63.93 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  49.33 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.72 
 
 		 831 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  60.61 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  30.15 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  51.47 
 
 		 814 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.3 
 
 		 790 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  51.56 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  50.75 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  37.5 
 
 		 663 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  57.14 
 
 		 599 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  45.78 
 
 		 895 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  52.46 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  33.82 
 
 		 1187 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  51.95 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  34.31 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  54.55 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  50.68 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  40.59 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  34.72 
 
 		 644 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  57.38 
 
 		 961 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  38.03 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  53.73 
 
 		 630 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  41.49 
 
 		 739 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  27.64 
 
 		 427 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>