35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0697 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  84.25 
 
 
369 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  100 
 
 
381 aa  794    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  45.3 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  37.09 
 
 
571 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  33.62 
 
 
501 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  29.95 
 
 
1278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  28.83 
 
 
494 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  29.74 
 
 
345 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  30.92 
 
 
493 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  28.89 
 
 
360 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  31.03 
 
 
1197 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  29.67 
 
 
488 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  30.15 
 
 
475 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  28.32 
 
 
422 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  24.07 
 
 
509 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  25.78 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  27.27 
 
 
317 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.59 
 
 
487 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.21 
 
 
533 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  25.81 
 
 
450 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  25.32 
 
 
679 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  25.77 
 
 
535 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  26.55 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  22.82 
 
 
524 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  22.71 
 
 
348 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  22.93 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  27.06 
 
 
317 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  23.48 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
644 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 
345 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.58 
 
 
316 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 
315 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>