100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0329 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  100 
 
 		 445 aa  914    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  59.02 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  41.22 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  60 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  58.26 
 
 		 266 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  58.59 
 
 		 259 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  37.28 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  47.58 
 
 		 254 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  45.25 
 
 		 260 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  41.67 
 
 		 264 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  43.81 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.34 
 
 		 474 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  45.45 
 
 		 244 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  43 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.67 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.75 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  39 
 
 		 257 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 401 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.28 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  28.39 
 
 		 392 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  43.03 
 
 		 691 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  37.87 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  44.37 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  40.93 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  38.5 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.76 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 560 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  44.96 
 
 		 233 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  37.85 
 
 		 1139 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  37.42 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  39.31 
 
 		 489 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  39.04 
 
 		 574 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  35.88 
 
 		 943 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.6 
 
 		 424 aa  87  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  43.86 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  38.03 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.93 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  29.73 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 884 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40.59 
 
 		 571 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.91 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.54 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.37 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.03 
 
 		 957 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  29.88 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.74 
 
 		 647 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  34.09 
 
 		 1259 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  33.81 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.33 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.19 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.43 
 
 		 2073 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  28.57 
 
 		 897 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  46.67 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.85 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.1 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  36.3 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.82 
 
 		 474 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.29 
 
 		 672 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  31.84 
 
 		 1016 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.39 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.2 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.71 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.18 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  30.63 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.33 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  37.63 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  29.73 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  29.1 
 
 		 963 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.71 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  24.84 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  32.59 
 
 		 1413 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.57 
 
 		 794 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.41 
 
 		 493 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  28.66 
 
 		 482 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  27.13 
 
 		 1141 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0016  Ricin B lectin  31.25 
 
 		 626 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.111216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.21 
 
 		 771 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  27.14 
 
 		 664 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  26.12 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  29.94 
 
 		 1187 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 824 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  34.23 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 239 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 569 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  27.59 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.08 
 
 		 982 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.32 
 
 		 789 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.8 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  24.47 
 
 		 186 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  25.93 
 
 		 240 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  32.03 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 709 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>