179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3944 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 466 aa  959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  52.02 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 634 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 634 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  48.39 
 
 		 634 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.42 
 
 		 628 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  47.1 
 
 		 627 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.21 
 
 		 353 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  46.73 
 
 		 329 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.67 
 
 		 347 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.16 
 
 		 376 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.57 
 
 		 350 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.56 
 
 		 340 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  39.44 
 
 		 502 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 		 580 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  68.67 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  39.02 
 
 		 355 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.84 
 
 		 517 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.82 
 
 		 474 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.64 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.71 
 
 		 648 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  63.51 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  35.65 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  35.35 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  59.03 
 
 		 401 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.24 
 
 		 355 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  35.95 
 
 		 362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  58.04 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  59.72 
 
 		 495 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  56.25 
 
 		 691 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  47.62 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.86 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.44 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  33.83 
 
 		 341 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32.74 
 
 		 2073 aa  153  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.06 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  35.56 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.46 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  34.09 
 
 		 316 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.13 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.77 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.77 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.77 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  33.77 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.69 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.12 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.12 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  51.75 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.72 
 
 		 315 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.04 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  45.75 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.29 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  40.25 
 
 		 1139 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.1 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  30.63 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.73 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.73 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  39.72 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  45.93 
 
 		 497 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  42.54 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  36.91 
 
 		 571 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.13 
 
 		 514 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  40.15 
 
 		 566 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  40 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  42.22 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 618 aa  100  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.99 
 
 		 1259 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  39.86 
 
 		 510 aa  97.1  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 1278 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.04 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.42 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  34.69 
 
 		 503 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  36.55 
 
 		 230 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  36.69 
 
 		 647 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.78 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.5 
 
 		 943 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.29 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  35.17 
 
 		 963 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  40.83 
 
 		 672 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  36.23 
 
 		 582 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  36.73 
 
 		 1413 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.56 
 
 		 507 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.29 
 
 		 884 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.37 
 
 		 695 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  34.56 
 
 		 957 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.86 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.54 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  27.49 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  35.46 
 
 		 771 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  31.58 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  36.76 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.21 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.51 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.85 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 1187 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  32.67 
 
 		 664 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  31.05 
 
 		 1016 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  33.86 
 
 		 1567 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  35.43 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>