200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3927 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  100 
 
 		 436 aa  892    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  55.47 
 
 		 497 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7019  alpha-L-arabinofuranosidase B  36.64 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7065  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.9 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0253597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  46.15 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 		 618 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  47.01 
 
 		 1139 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  45.04 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.22 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  46.56 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  45.65 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  45.11 
 
 		 691 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  48.12 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.14 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  43.94 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  41.67 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  38.03 
 
 		 571 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.79 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  41.79 
 
 		 1413 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.22 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  41.72 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  44.12 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.57 
 
 		 648 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.93 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  44.74 
 
 		 647 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  39.69 
 
 		 672 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  37.68 
 
 		 569 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.3 
 
 		 514 aa  93.6  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.25 
 
 		 503 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  39.29 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  38.46 
 
 		 884 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  44.44 
 
 		 425 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.81 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  34.53 
 
 		 1567 aa  90.5  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.88 
 
 		 507 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  42.86 
 
 		 503 aa  89.7  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  41.13 
 
 		 489 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.81 
 
 		 494 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  40.3 
 
 		 1187 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  41.67 
 
 		 537 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  42.66 
 
 		 794 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.46 
 
 		 957 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  35.48 
 
 		 1222 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  41.27 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  35.1 
 
 		 789 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.88 
 
 		 1259 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  35.57 
 
 		 943 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.86 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  40.6 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.95 
 
 		 1016 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  34.35 
 
 		 2073 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  39.06 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  36.54 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  38.58 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  35.25 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  36.03 
 
 		 963 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  39.69 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.32 
 
 		 756 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  40.32 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  38.76 
 
 		 516 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  33.56 
 
 		 615 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  37.1 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 		 709 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.99 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  38.85 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.9 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.58 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 		 806 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  36.99 
 
 		 567 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.89 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  33.87 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  35.56 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  34.72 
 
 		 644 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  50.68 
 
 		 1347 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.12 
 
 		 801 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.81 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  39.39 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  32.12 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  36 
 
 		 1100 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.58 
 
 		 982 aa  73.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.84 
 
 		 1072 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  35.76 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  46.43 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  37.21 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  35.38 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.59 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  37.3 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  37.6 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32 
 
 		 695 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.92 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  37.04 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>