222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4198 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  82.38 
 
 		 794 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  100 
 
 		 487 aa  988    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  82.8 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.76 
 
 		 567 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  42.5 
 
 		 627 aa  223  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  42.95 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  44.73 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  43.97 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  44.44 
 
 		 347 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  41.4 
 
 		 686 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  37.66 
 
 		 322 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  37.5 
 
 		 326 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  38.36 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  38.36 
 
 		 376 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  35.14 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  36.39 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  37.78 
 
 		 326 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  33.65 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  36.19 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  33.33 
 
 		 644 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  36.18 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.51 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  31.29 
 
 		 337 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  32.08 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  34.18 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  28.99 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  33.13 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  32.55 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  33.23 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  32.04 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.5 
 
 		 865 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  31.37 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  32.13 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  30.96 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  30.5 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  30.5 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  30.5 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  31.69 
 
 		 427 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  30.28 
 
 		 427 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  29.44 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  30.24 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  28.83 
 
 		 746 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  37.99 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  33.97 
 
 		 1413 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  30.5 
 
 		 412 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  32.09 
 
 		 325 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  31.09 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.41 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  37.78 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 1259 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.44 
 
 		 691 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.04 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.57 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.97 
 
 		 672 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.33 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  35 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  39.33 
 
 		 647 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.09 
 
 		 1139 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  32.4 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.99 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  37.5 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  33.81 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.93 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  34.81 
 
 		 571 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  37.4 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  37.9 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.85 
 
 		 618 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.21 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  35.92 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.66 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3447  pectin methylesterase-like  29.28 
 
 		 1081 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000110016  hitchhiker  0.000230846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.57 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.12 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 806 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  30 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.33 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  28.57 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.59 
 
 		 863 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.72 
 
 		 2073 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  33.51 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>