161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0964 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  71.37 
 
 
239 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.82 
 
 
476 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.33 
 
 
487 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.2 
 
 
436 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.66 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.66 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.48 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.82 
 
 
1016 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  33.07 
 
 
691 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  24.3 
 
 
569 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  39.56 
 
 
563 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  46.15 
 
 
488 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  43.21 
 
 
522 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  40.96 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  43.33 
 
 
482 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.46 
 
 
737 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  40 
 
 
427 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37 
 
 
401 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.3 
 
 
672 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  32.86 
 
 
806 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  29.23 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  30.65 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  26.82 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  30.08 
 
 
468 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.96 
 
 
494 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  32.31 
 
 
368 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  40 
 
 
1347 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35 
 
 
497 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
806 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  32.33 
 
 
560 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  29.23 
 
 
492 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  35.96 
 
 
863 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  34.74 
 
 
982 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  24.23 
 
 
571 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  32.35 
 
 
943 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  33.07 
 
 
516 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  28.57 
 
 
566 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.49 
 
 
824 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  32.58 
 
 
497 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.43 
 
 
1567 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  25.33 
 
 
493 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  25.87 
 
 
425 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  30.77 
 
 
1259 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  31.75 
 
 
634 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.35 
 
 
474 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  26.58 
 
 
172 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.71 
 
 
756 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  29.77 
 
 
489 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.16 
 
 
520 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.93 
 
 
461 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  38.64 
 
 
653 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.75 
 
 
374 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  31.2 
 
 
664 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30 
 
 
489 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  30.6 
 
 
603 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  25.97 
 
 
412 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  25.44 
 
 
642 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.48 
 
 
647 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  29.09 
 
 
451 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  42.37 
 
 
1148 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  37.5 
 
 
801 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  26.03 
 
 
491 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.25 
 
 
500 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  35.06 
 
 
472 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.86 
 
 
537 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 
503 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  31.11 
 
 
411 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  25.58 
 
 
498 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  36.36 
 
 
490 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.12 
 
 
493 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.77 
 
 
803 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
709 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  32.59 
 
 
1100 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  28.46 
 
 
576 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.81 
 
 
507 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  30.84 
 
 
417 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  30.93 
 
 
186 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.01 
 
 
466 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.5 
 
 
426 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  31.48 
 
 
732 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  33.33 
 
 
497 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.47 
 
 
547 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.06 
 
 
801 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.93 
 
 
627 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 
933 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  40.68 
 
 
726 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.59 
 
 
507 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.13 
 
 
495 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  40.51 
 
 
492 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.08 
 
 
1072 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  28.04 
 
 
382 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  28.78 
 
 
400 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>