37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3769 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  100 
 
 		 400 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  41.12 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  37.73 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  35.01 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  38.08 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  36.19 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.65 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.33 
 
 		 803 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.4 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  28.86 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  30 
 
 		 801 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  28.47 
 
 		 240 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  28.12 
 
 		 497 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  26.36 
 
 		 472 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.3 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  28.03 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  28.91 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  24.35 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.61 
 
 		 933 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  24.81 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  28.87 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  24.62 
 
 		 801 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  24.62 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.16 
 
 		 1072 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  26.12 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 1577 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.81 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  30.71 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  25.81 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  25.81 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  30.88 
 
 		 568 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  25.38 
 
 		 558 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  24.6 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3693  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.257313  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.89 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  29.37 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>