103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3154 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  100 
 
 		 382 aa  765    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  37.96 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  41.63 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  39.82 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  36.11 
 
 		 320 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.52 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  34.81 
 
 		 801 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  32 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.4 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  24.42 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.82 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  35.88 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  30.16 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.24 
 
 		 5203 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  26.98 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  36.51 
 
 		 568 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  30.97 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  31.67 
 
 		 5166 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  36.59 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.87 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.65 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  39.74 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.38 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  34.88 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.6 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.46 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  34.85 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.3 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  30.4 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.46 
 
 		 490 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.71 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  29.55 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 801 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  28 
 
 		 803 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.08 
 
 		 933 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  33.33 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  30.47 
 
 		 165 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  35.56 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.2 
 
 		 497 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  29.69 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  35.53 
 
 		 603 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  27.81 
 
 		 1337 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  27.81 
 
 		 1337 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 597 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.23 
 
 		 500 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  27.64 
 
 		 801 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  39.02 
 
 		 535 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  32.8 
 
 		 732 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.57 
 
 		 890 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.13 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  26.36 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  24.34 
 
 		 733 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 2047 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  27.78 
 
 		 586 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.64 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  26.42 
 
 		 5517 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.82 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  28.79 
 
 		 1263 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  30.68 
 
 		 1016 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  29.95 
 
 		 3373 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  27.01 
 
 		 2604 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  29.41 
 
 		 493 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  32.5 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  27.12 
 
 		 965 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  27.12 
 
 		 965 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  27.82 
 
 		 492 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.8 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  30.61 
 
 		 2112 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  31.2 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  25.52 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  25.52 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  25.48 
 
 		 2876 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.5 
 
 		 756 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  27.57 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  35.45 
 
 		 979 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  27.78 
 
 		 516 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  32.21 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  41.57 
 
 		 1243 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  25.89 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  25 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  32.18 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.03 
 
 		 982 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 1123 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  27.91 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.9 
 
 		 627 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  42.19 
 
 		 870 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  22.27 
 
 		 507 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 488 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  36.11 
 
 		 941 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  23.79 
 
 		 5544 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6622  Ricin B lectin  32.99 
 
 		 172 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111925  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  31 
 
 		 807 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  31 
 
 		 858 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 858 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 858 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>