53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4150 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  100 
 
 		 333 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4151  Ricin B lectin  44.94 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  42.72 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  38.96 
 
 		 382 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3769  Ricin B lectin  37.73 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  39.82 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  31.06 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.18 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  30.37 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.37 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.77 
 
 		 498 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  30.61 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.01 
 
 		 472 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  28.35 
 
 		 801 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.13 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.92 
 
 		 461 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  28.68 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  31.78 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.91 
 
 		 801 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.71 
 
 		 589 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.48 
 
 		 490 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.54 
 
 		 1072 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  25.79 
 
 		 492 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  32 
 
 		 2890 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  37.08 
 
 		 892 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  27.13 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  28.68 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  29.13 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  33.59 
 
 		 5544 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  32.03 
 
 		 803 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.13 
 
 		 489 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 452 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.01 
 
 		 933 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  29.32 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  34.07 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  34.04 
 
 		 1519 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.73 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  26.81 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1537 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  26.52 
 
 		 547 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 5517 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 5166 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.83 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  36.71 
 
 		 492 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  27.46 
 
 		 2604 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.37 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  32.35 
 
 		 3373 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30.88 
 
 		 3634 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  31.06 
 
 		 165 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 240 aa  42.7  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  34.02 
 
 		 2876 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  25.13 
 
 		 642 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  28.21 
 
 		 275 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>